はい、可能です。
以下は設定の一例です。
例）/path/to/not-found.js だけが 404 で、対象としたい場合
- 仮想パス一覧から「仮想パス追加」を押下する。
- 基本タブの「仮想パスタイプ」から「個別パス＋ファイル名」を選択する。
- 「仮想ベースパス」に「/path/to/」を入力し、拡張パス（ファイル名）に「not-found.js」を入力する。
- キャッシュ挙動タブの「オリジン応答ヘッダ」で「Cache-Controlヘッダを無視してキャッシュ」にチェックを入れる。
- 「キャッシュTTL指定」の「404」にチェックを入れ、任意の値を指定し、その他のステータスコードには「0」を指定する。
※「0」を指定すると no-cache と同じ挙動となります - 「設定保存」を押下する。
- CDNホスト一覧から、該当のホストをチェックし「CDN設定反映」を押下する。
こちらの例は、特定の１ファイルのみですが、「仮想パスタイプ」で「正規表現」を指定することで、複数ファイルを対象にすることも可能です。